注册了公司名称（营业执照）就等于商标受保护了吗？

不能等同。营业执照上登记的企业名称受《企业名称登记管理规定》保护，但这种保护有地域限制——只在登记地市场监督管理局的管辖区域内有效，且只保护你完整的企业名称不被冒用。商标权则是全国性的，保护的是你的品牌标识不被他人在相同或类似商品上使用。举个例子：你在北京注册了"北京XX科技有限公司"，深圳的同行也可以注册"深圳XX科技有限公司"（只要当地没有重名），但如果你把这个名字注册成商标，全国任何人都不能随便用了。